September en oktober zijn altijd drukke maanden, zo ook voor mij als onderzoeker. Terwijl ik de laatste cellen aan het verwerken ben voor het aankomende experiment (waarover straks meer), zijn er nog veel andere dingen gebeurd. Ik heb samen met Anne van Veen een voorstelling over proefdieren gegeven bij het Meet the Future festival, ik heb mijn onderzoek laten zien bij de Eurotox2018 conferentie in Brussel en ik heb mijn eerste hoorcollege gegeven aan studenten van de Hogeschool Utrecht.
Victoria de Leeuw op Meet the Future festival
Ook op wetenschappelijk vlak hebben we niet stil gestaan: we hebben namelijk ons eerste artikel opgestuurd naar een wetenschappelijk tijdschrift. En ondertussen zijn we druk bezig met de volgende ronde experimenten met een hele gave techniek. Hier wil ik jullie graag meer over vertellen: Next Generation Sequencing, kortweg NGS.
Next gen wat? Next generation sequencing
NGS is een techniek om te kijken naar genexpressie van alle genen in een cel. Je kan het zo zien: alle genen in je cel, je DNA, is als een boek. Voor het maken van eiwitten worden er uit dit boek kopietjes gemaakt en die losse kopietjes (messenger RNA) gaan we meten. De gedachte is dat als een bepaald proces in een cel heel hard aan wordt gezet, dat je dat kan terugvinden in het aantal kopietjes die worden gemaakt van genen die in dit proces betrokken zijn. Zo kan je kijken welke processen in de cel worden aangezet door een bepaalde stof.
Spannend en relevant onderzoek
Oké, leuk, maar waarom is dit belangrijk om te weten? Als we weten welke processen worden aangezet door een bepaalde stof, kunnen we een voorspelling doen over hoe een stof cellen beïnvloedt. En als deze processen schadelijk zijn, weten we dus dat deze stof mogelijk ook schadelijk is voor bijvoorbeeld de vroege ontwikkeling van het embryonale zenuwstelsel.
Deze techniek gaan we toepassen op twee medicijnen die erg op elkaar lijken, maar net even iets anders doen en mogelijk schadelijk zijn voor hersenontwikkeling van het embryo. Ook is de ene stof bij dezelfde concentratie minder schadelijk dan de ander. We hopen door middel van NGS te ontdekken wat de mechanismen van deze stoffen zijn die mijn cellen beïnvloeden. Ook willen we te weten komen waarom de ene stof schadelijker is dan de andere. Dit is spannend en heel relevant, want we weten nog niet zo veel van deze stoffen!
Zodra we de resultaten hebben, horen jullie weer van me. Tot de volgende blog!
Victoria